Man kann leider nur den Ort der Aufnahme frei wählen.
Für die Konfigurationsdateien geht das gar nicht und wenn man den Speicherort des Protokollordners ändert, wird der immer wieder überschrieben.

Man sollte die Speicherorte von allen drei Dingen (Protokolldateien, Aufnahmen und Konfigurationsdateien) frei wählen können.
Am besten geht das schon auf der Programmoberfläche, zumindest aber in der Konfigurationsdatei.

Firefox hat das zum Beispiel gut gemacht, die haben eine eigene Konfigurationsdatei für den Speicherort des Ordners mit Konfiguration, Protokoll usw.