Als Provider ist die FritzBox konfiguriert und oft werden Anrufe im PhonerLite erst unterschiedlich lang verzögert angezeigt - dadurch bemerkbar, dass das Telefon an der FritzBox ohne Verzögerung läutet.

Das Registrierungsintervall hat nichts damit zu tun, wenn ein Ruf verzögert gemeldet wird.
Dein PC befindet sich in keinem Standby-Modus? Hast du eventuell Dinge wie STUN oder UPnP in PhonerLite aktiviert? Diese brauchst du NICHT, wenn du dich lokal an der Fritzbox registrierst.
Öffne doch mal das Debug-Fenster von PhonerLite (Über das Hilfe-Menü ein- und ausblendbar). Wenn du dann dort einmal reinklickst und die Entf-Taste drückst, wird der bisherige Inhalt gelöscht. Lass dich nun Anrufen. Diese Ausgaben kannst du mir gerne per E-Mail (nicht hier im Forum!) zusenden. Dann kann ich sehen, wo hier eventuelle Verzögerungen auftreten.

Sachverhalt liegt nach wie vor vor. Das Fangen eines Logs hierzu steht aber noch aus.

Was hast du für ein Registrierungsintervall eingestellt? In der Antwort auf die Registrierung (deine obige Meldung) steht 300 Sekunden. In PhonerLite kannst du durchaus kleinere Werte einstellen.

Du kannst auch gerne mal 60 Sekunden ausprobieren. Nach dem Ändern des Wertes musst du speichern, damit das auch aktiv wird.

Dein PC mit PhonerLite und das Smartphone nutzen aber schon unterschiedliche Nebenstellen an der Fritzbox, oder? Wenn das der Fall ist und mit dem Smartphone ebenfalls das gleiche Problem auftritt, dann scheint tatsächlich in der FB etwas nicht zu stimmen.