Man kann den Pfad nicht frei konfigurieren.
Wenn PhonerLite in einem Verzeichnis mit Schreibrechten installiert wurde, dann landen die Aufzeichnungen im gleichen Verzeichnis. Bei Vista/Win7 hat man normalerweise unterhalb von "C:\Programme" (bzw. "C:\Program Files") keine Schreibrechte. Deshalb werden alle dynamischen Dateien (Ini-Dateien, Logbuch, ...) im Benutzerverzeichnis gespeichert. Der passende Pfad dazu lautet: "%APPDATA%\PhonerLite". Das kannst du so in deinem Explorer angeben, du landest dann automatisch in dem richtigen Verzeichnis.
Solltest du PhonerLite in einem ganz anderen Verzeichnis mit vollen Schreibrechten installiert haben, so kannst du das Speichern in "%APPDATA%\PhonerLite" trotzdem erzwingen. Dazu bearbeitest du die Datei "settings.ini" und änderst die Zeile "UserSpecific=0" in "UserSpecific=1".