Nein, da gibt es keinerlei Einstellung in PhonerLite, da PhonerLite gar nicht weiß, ob es sich um eine ausländische Nummer handelt oder nicht. So wie du die Nummer eingibst, wird der Ruf aufgebaut. 
Ich habe keinerlei Erfahrungen mit fonial . Nutzt du den fonial-Account direkt in PhonerLite oder registriert sich PhonerLite beispielsweise an einer Fritzbox und diese ist dann mit fonial "verbunden"? Wenn PhonerLite also als Nebenstelle an einer Fritzbox arbeitet, so muss in der Fritzbox die Berechtigung für ausländische Rufe konfiguriert werden.
Solltest du direkt fonial benutzen, ist das der gleiche Account, den auch Zoiper nutzt?

Dann kann ich dir leider nicht weiterhelfen. PhonerLite macht wie gesagt keinen Unterschied, ob du national oder international anrufst.
Du kannst mir aber gerne mal den Inhalt des Debug-Fensters von PhonerLite nach einem solchen abgelehnten internationalen Ruf per E-Mail (nicht hier im Form!) zusenden.